Чупливият футболист се присъедини към „армейския“ клуб през февруари 2020 година. През май 2021 година Варела спечели Купата на България, след победа на финала с 1:0 над Арда. През настоящия сезон той не попадна в плановете на старши треньора Саша Илич и по този начин се стигна до раздялата му с ЦСКА. „Пожелаваме на Федерико Варела здраве, късмет и успехи в бъдещите му футболни предизвикателства!“, пише в сайта на ЦСКА.
